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Aries, la nouvelle constellation du calcul mutualisé


L’offre HPC du DIT en clusters mutualisés s’est étendue avec l’arrivée d’Aries, le 1er février 2012.



Shared HPC clusters managed by DIT are expanded with Aries’arrival, on February the 1st, 2012.


Michela THIEMARD


Afin de renouveler les clusters du DIT, en vue de l’arrêt de Callisto, Antares, Jupiter et Pleiades qui arriveront au terme de leur vie à fin 2012, un nouveau cluster, nommé Aries, a rejoint l’offre des clusters mutualisés.
Suite à un appel d’offres OMC qui s’est déroulé entre avril et septembre 2011, sur décision du   CoPil HPC, le DIT a commandé un cluster IBM de 1104 cœurs AMD avec la possibilité de doubler sa capacité, tant en nombre de nœuds qu’en espace de stockage, sur 2012. Aries sera mis en production le 1er février 2012.

Configuration hardware

Architecture du cluster Aries

Une description complète est disponible sur le site Web. Cependant, ses caractéristiques principales sont les suivantes :

  • 23 nœuds de calcul
    • quadri-processeurs AMD Opteron 6176 (Magny-Cours) à 2.3 GHz, dodeca-cœurs, pour un total de 48 cœurs par nœud
    • 192 GB RAM/nœud, i.e. 4 GB de RAM par cœur
  • 1 serveur frontal
    • bi-processeurs AMD Opteron 6176 (Magny-Cours) à 2.3 GHz, dodeca-cœurs, pour un total de 24 cœurs
    • 24 GB de RAM
    • 2 disques internes de 2 TB en RAID 1
  • un stockage GPFS de 43.6 TB effectifs
    • 6.6 TB pour home
    • 37 TB pour scratch
    • accessibles par 2 serveurs de fichiers Intel.

Les nœuds de calcul, la frontale ainsi que le système de fichiers sont connectés via un switch Mellanox par un réseau d’interconnexion rapide InfiniBand QDR à 40 Gb/s.
Toute l’infrastructure, installée dans la salle serveurs du bâtiment de mathématiques, occupe 62 U (rack unit) logés dans 2 racks de 52 U Knürr avec porte arrière refroidissante passive à eau de type CoolTherm®.

Configuration logicielle

Le système d’exploitation est SLES 11 (SuSE Linux Entreprise Server) et le cluster est géré par xCAT2. L’outil d’ordonnancement des tâches est PBSPro, qui est également utilisé sur les autres clusters gérés par le DIT. Sur Aries, on trouve les logiciels usuels pour du calcul, entre autres des compilateurs (gcc, Intel), des logiciels de dialogue inter-processus (Open MPI, MVAPICH2), des librairies mathématiques (ATLAS, LAPACK, SCALAPACK,...), MATLAB,... Il est bien évidemment toujours possible de demander l’installation de nouveaux logiciels pertinents pour le calcul.

Accès à Aries

Le cluster est disponible pendant 4 ans du 1er février 2012 au 31 janvier 2016. Il est possible d’y accéder en mode production ou en mode test.

  • Mode production
    • Achat de parts du cluster formé de 21 nœuds. Ces parts sont définies à l’avance pour chaque période de 6 mois.
    • Achat de nœuds privés jusqu’à concurrence d’un cluster de 44 nœuds.
  • Mode test
    • accès gratuit à la machine pour des jobs de courte durée et à un nombre limité de nœuds.

Remarquons que 2 nœuds sont dédiés au débogage du lundi au vendredi, de 9 heures et 17 heures.
Un échéancier complet relatant les périodes de financement, leurs prix, les modalités pour l’achat de nœuds privés ainsi que les caractéristiques de gestion des jobs sont disponibles sur le Web.
Tentés par ce nouveau cluster ? Alors n’hésitez pas à le tester en demandant un compte sur le site ou à nous contacter pour de plus amples renseignements.





Glossaire

Copil HPC :
comité de pilotage du calcul à haute performance à l’EPFL.


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